2020年9月27日日曜日

COVID-19 対策の諸問題(1) 日本の特異性

『科学』 2020年10月号

濱岡 豊「COVID-19 対策の諸問題(1) 日本の特異性」

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・白黒で掲載された図をカラーで掲載しています。クリックで拡大されます。原稿作成時時点でのデータです(2020年8月末頃)。

注)縦軸、横軸とも常用対数目盛であることに注意。ラベルが赤は、本文中で今後言及する国。220ヵ国の国名を示すと煩雑になるので、このサイトで検査データが公開されている90ヵ国についてのみラベルを示した。
出所)Our world in dataの公開データより作成。
図1  累積陽性者数と累積死亡者数


注)縦軸、横軸とも常用対数目盛であることに注意。ラベルが赤は、本文中で今後言及する国。検査データが公開されているのは90ヵ国。
出所)図表1参照。ただし日本の検査データは厚労省ページより入力した。
図 2 人口あたりの累積検査人数と陽性率




):検査数、赤:陽性数、黒:死亡数(いずれも「人」)。緑:陽性率(%)。縦軸は常用対数目盛。

 国名の下の数字は人口。日本の検査数は累積のみが公開されているので、差分をとって1日あたりを算出。

 各図の下部の数字の上段は累積検査人数/累積陽性者数/累積死亡者数/累積陽性率。

上段は1日あたりの検査人数/陽性者数/死亡者数/陽性率の最大値。 

データの出所は図2参照。
図3  8ヵ国の1日あたりの検査数、陽性者数、死亡者数、陽性率のトレンド




注) グラフに収めるために、検査人数については1/10倍、モビリティについては1/5倍した。前者で1000とあれば10000人に検査したことを意味し(左側の目盛り)、後者で-10とあれば-50%変化したこと(右側の目盛り)を意味する。
凡例の( )内は日次データでの最大値。 ただしモビリティについては最小値。
出所)検査人数、(報告日ベースの)陽性者数は厚労省のホームページ。厚労省は累積数を公開しているので、差分を日次データとした。
Apple Mobility Reports. https://www.apple.com/covid19/mobility
図4 日本におけるCOVID-19関連の時系列データとイベント



・関連の主要イベント、政策
1月15日 国内で1例目の患者確認
2月3日 ダイヤモンド・プリンセス号、横浜帰港。
2月28日-3月19日 北海道 緊急事態宣言
3月2日 全国小中高への休校要請 (発表は2月27日)
3月10日 新型インフルエンザ等対策特別措置法の一部を改正する法律案国会提出。3月14日より施行。
3月24日 JOCオリンピック延期発表
4月7日 緊急事態措置(埼玉県、千葉県、東京都、神奈川県、大阪府、兵庫県及び福岡県)
4月16日 同 全都道府県(5/6まで)
5月4日 延長 5月 31 日まで全都道府県
5月14日 北海道、埼玉県、千葉県、東京都、神奈川県、京都府、大阪府、兵庫県以外解除
5月21日 京都府、大阪府、兵庫県解除
5月25日 緊急事態か終了宣言
6月1日 一都三県、北海道と他県との移動自粛要請
6月19日 移動自粛要請解除
7月22日 Go To トラベルキャンペーン開始



脚注
(脚注番号は入っていませんが概ね本文の登場順に並んでいます)

[1] WHO “SITUATION REPORT – 1” https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200121-sitrep-1-2019-ncov.pdf?sfvrsn=20a99c10_4 (以下、日付がないものは2020815日アクセス)

[1] WHO “Situation Report – 209“ https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200816-covid-19-sitrep-209.pdf?sfvrsn=5dde1ca2_2

[1] https://raw.githubusercontent.com/owid/covid-19-data/master/public/data/owid-covid-data.csv

なお、日本の検査データについては欠損値が多いため厚労省のページから取得した。

https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000121431_00086.html

[1] 感染者の一部が検査によって陽性者として見いだされる。以下、検査によって見いだされた者を「陽性者」、そのうち厚労省のデータについては「患者」、モデルや概念におけるこれらを包含するすべてを「感染者」と呼ぶ。

[1] 縦横軸とも常用対数を取っているので、log10(死亡者数)=βlog10(陽性者数)という関係があることになる。

[1] 例えば2020316WHO事務総長Tedros氏は But we have not seen an urgent enough escalation in testing, isolation and contact tracing – which is the backbone of the response.”” Once again, our key message is: test, test, test.と述べた。 https://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19---16-march-2020

 

[1] スエーデン、ドイツ、中国なども興味深いが、このサイトでは日次の検査データ公開されていない。

[1] 安倍総理の春節祝賀ビデオメッセージ https://nettv.gov-online.go.jp/prg/prg18405.html

[1] WHOの事務総長の32日の会見

 The epidemics in the Republic of Korea, Italy, Iran and Japan are our greatest concern.

 https://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19---2-march-2020

[1] WHOの事務総長3月18日の会見。

”A month ago, the Republic of Korea was faced with accelerating community transmission. But it didn’t surrender.

It educated, empowered and engaged communities; 

It developed an innovative testing strategy and expanded lab capacity; 

It rationed the use of masks;

It did exhaustive contact tracing and testing in selected areas; 

And it isolated suspected cases in designated facilities rather than hospitals or at home.

As a result, cases have been declining for weeks. At the peak there were more than 800 cases, and today the report was only 90 cases.

WHO is working in solidarity with other countries with community transmission to apply the lessons learned in Korea and elsewhere, and adapt them to the local context.”

https://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19---18-march-2020

[1] WHOの事務総長3月18日の会見。

”A month ago, the Republic of Korea was faced with accelerating community transmission. But it didn’t surrender.

It educated, empowered and engaged communities; 

It developed an innovative testing strategy and expanded lab capacity; 

It rationed the use of masks;

It did exhaustive contact tracing and testing in selected areas; 

And it isolated suspected cases in designated facilities rather than hospitals or at home.

As a result, cases have been declining for weeks. At the peak there were more than 800 cases, and today the report was only 90 cases.

WHO is working in solidarity with other countries with community transmission to apply the lessons learned in Korea and elsewhere, and adapt them to the local context.”

https://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19---18-march-2020

[1] https://www.kantei.go.jp/jp/singi/novel_coronavirus/th_siryou/kihon_h_0525.pdf

[1] 影響を与えたと表現したが、実際は政府の意を汲んだ提言をしていた可能性もある。ただし、「新型コロナウイルス感染症対策本」「新型コロナウイルス感染症対策専門家会議」とも、議事概要しか作成されていないので検証することもできない。

https://www.kantei.go.jp/jp/singi/novel_coronavirus/taisaku_honbu.html

[1] AppledrivingtransitwalkingGooglegrocery_and_pharmacyparkstransitworkplacesresidentialについて集計している。目視したところ「乗り換え() transit」がともに緊急事態宣言中に最も大きく低下するので、これを用いた。なお、Googleはベースラインからの変化率のデータだが、Appleはベースラインを100%とした移動度を提供しているので、100を差し引いて変化率とした。

[1] https://www.kantei.go.jp/jp/singi/novel_coronavirus/th_siryou/kinkyutaiou_gaiyou_corona.pdf

[1] https://www.kantei.go.jp/jp/singi/novel_coronavirus/th_siryou/kihonhousin.pdf

[1] https://www.kantei.go.jp/jp/singi/novel_coronavirus/th_siryou/kihon_h(4.7).pdf

[1] https://corona.go.jp/expert-meeting/pdf/kihon_h_0525.pdf

[1]ただし、37.5度の熱があっても4日間は自宅で待機のように制約していた。




参考文献

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Bonita, R., R. Beaglehole, and T. Kjellström (2006), Basic Epidemiology 2nd Edition.: 木原雅子、木原正博監訳『WHOの標準疫学』三煌社, 2008http://whqlibdoc.who.int/publications/2006/9241547073_jpn.pdf.

 

Furuse, Yuki, Sando Eiichiro, Tsuchiya Naho, Miyahara Reiko, Yasuda Ikkoh, K. Ko Yura, Saito Mayuko, Morimoto Konosuke, Imamura Takeaki, Shobugawa Yugo, Nagata Shohei, Jindai Kazuaki, Imamura Tadatsugu, Sunagawa Tomimasa, Suzuki Motoi, Nishiura Hiroshi, and Oshitani Hitoshi (2020), "Clusters of Coronavirus Disease in Communities, Japan, January–April 2020," Emerging Infectious Disease journal, 26 (9).

 

Linton, N. M., T. Kobayashi, Y. Yang, K. Hayashi, A. R. Akhmetzhanov, S. M. Jung, B. Yuan, R. Kinoshita, and H. Nishiura (2020), "Incubation Period and Other Epidemiological Characteristics of 2019 Novel Coronavirus Infections with Right Truncation: A Statistical Analysis of Publicly Available Case Data," J Clin Med, 9 (2).

 

Pollack, Todd and et al. (2020), "Emerging Covid-19 Success Story: Vietnam’s Commitment to Containment," Our World in Data https://ourworldindata.org/covid-exemplar-vietnam accessed 2020/8/20.

 

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WHO (2020), The Report of the Who China Joint Mission on Covid-19 Final Report: WHO https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/who-china-joint-mission-on-covid-19-final-report.pdf accessed 2020/02/29.

 

新型コロナウイルス感染症対策専門家会議 (2020a), "新型コロナウイルス感染症対策の状況分析・提言(2020  3  19 )," https://www.mhlw.go.jp/content/10900000/000610566.pdf accessed 2020/08/22.

 

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錢瓊毓 (2020), "台湾におけるcovid-19対応," 日本医師会 COVID-19有識者会議 https://www.covid19-jma-medical-expert-meeting.jp/topic/3103 2020/8/20 アクセス.